论文知网查重之所以存在较大误差，主要是因为其查重算法并非完全依赖于自主研发，而是采用了成熟的第三方查重系统。这些第三方系统虽然能够提供较快的查重速度，但在查重准确性方面存在一定局限性。此外，论文知网对于一些特殊格式的文献或内容的查重能力相对较弱，导致查重结果不够准确。

要提高论文知网查重的准确性，可以采取一些措施。首先，建议在上传论文进行查重时，尽量使用标准格式的文档，避免特殊格式或排版过于复杂的文献。其次，可以尝试使用多个不同的查重工具进行对比，以提高查重结果的准确性。另外，定期更新论文知网的查重系统和算法，保持系统的最新性和准确性，也是提高查重准确性的有效途径。